O Mistério da Coniunctio é uma investigação sobre a separação e a síntese dos opostos psíquicos em alquimia. A alquimia nos oferece uma percepção única das profundezas da psique inconsciente, e Jung revelou que, se prestarmos atenção, com seriedade, às imagens alquímicas, encontraremos o mesmo material que surge m nossos sonhos. Os fatores que se encontram na coniunctio são concebidos como opostos, seja confrontando-se por hostilidade ou atraindo-se por amor. Eles connstituem a anatomia mais básica da psique e mantêm a psique ativa. O par de oposotos mais crucial e mais aterrador é o do bem e do mal, e a sobrevivência do ego depende de como ele se relaciona com esse par.