A série conta a história de Gon Freecss, um garoto de 12 anos que pretende se tornar um hunter, um caçador de tesouros, lugares perdidos e criaturas estranhas.

Contudo, ao contrário da maioria dos Hunters que procuram fama e dinheiro, o herói da história tem uma motivação maior para querer ser um caçador — encontrar seu pai — um dos mais famosos hunters do mundo.

Mas não é qualquer um que pode se tornar um hunter. Para poder praticar essa reconhecida profissão, é necessário ter uma licença especial — e para tirá-la é preciso passar — e sobreviver — a exames com milhares de inscritos. Uma vez aprovado e com sua licença hunter em mãos, o caçador passa a ter direito a acessar áreas restritas, informações secretas e consegue acumular facilmente uma grande fortuna de acordo com seus feitos – incluindo ir atrás de hunters que usam seus poderes para objetivos escusos.